กลุ่มงานแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือก เพื่อพัฒนาจังหวัดจันทบุรี ให้ก้าวสู่ความมั่นคง มั่งคั่งและยั่งยืน ต้องอาศัยความร่วมมือจาก
ทุกภาคส่วนในการขับคลื่อน มีการกำหนดเป้าหมายสำคัญ คือ การผสมผสานการแพทย์แผนไทย และการแพทย์ทางเลือก กับการแพทย์สมัยใหม่ในระบบสาธารณสุขอย่างครบวงจร เพื่อแก้ปัญหาสาธารณสุขของจังหวัดจันทบุรี ชุมชนมีส่วนร่วมมีเครือข่าย และพัฒนาระบบบริการตาม Service Plan สาขาการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ผสมผสาน

“เป็นองค์กรต้นแบบด้านการแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือก ผลิตเภสัชกรแผนไทย และแพทย์แผนไทยที่มีคุณภาพ
เพื่อประชาชนมีสุขภาพดี”

“ซื่อสัตย์ สามัคคี มีวินัย ใจบริการ ทำงานเป็นทีม”

กลุ่มงานแพทย์แผนไทยและการแพทย์ทางเลือก มีภารกิจในการพัฒนารูปแบบบริหาร บริการจัดการองค์ความรู้และสร้างความเชื่อมั่นประชาชนใน
การดูแลสุขภาพด้วยศาสตร์ แพทย์แผนไทย ส่งเสริมการวิจัย คุ้มครอง อนุรักษ์ และส่งเสริมภูมิปัญญาการแพทย์แผนไทย กำกับดูแลมาตรฐาน
ด้านคุณภาพและความปลอดภัยของผลิตภัณฑ์สมุนไพร ผลิตเภสัชกรแผนไทยและแพทย์แผนไทยที่มีคุณภาพ